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为什么进行蛋白质测序?
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这个问题问的非常有意义.没有学生物的人也知道,基因组测序,为了破译遗传密码.现在密码已破,那进行蛋白质组测序有必要吗?2 W# D3 F& {1 U: w' _
基因研究贯穿了整个20世纪,100多年里,双螺旋结构的提出,中心法则的发现,直至基因组的重大突破,使基因研究达到了前所未有的深度与广度.
6 `6 R. z% X5 E; O4 M5 R' u1 E 然而,基因只是信息的携带者,蛋白质才是执行者.基因组计划有其固有的局限性,基因组测序是否正确,要从其表达的蛋白来验证,否则,只是一堆乱码而已.3.5万左右基因中一半以上是理论推断,需要从蛋白质角度确认.而且,从蛋白质研究的自身发展来看,我们无法逃避蛋白质组表达谱分析,只是时间问题而已.# m, P* ~9 y( w0 V
以前,对蛋白质的研究是优于基因的,因为PCR,测序自动化使其发展迅猛,这我在明天的生物中提了.80年代末,Hillen Kamp发展的激光解析质谱,Fem J设计的电喷雾质谱可以高效,精确的测量生物大分子的质量,并测定部分序列,进而用于数据库的检索.Mann M等再此基础上通过建立"肽质量指纹图谱与肽序列标签"等技术实现了质谱对蛋白质进行大规模准确快速自动化的测序. \ _; Z" |+ x) @
蛋白质组(即protenome=protein+genome)是两个词的组合,Wilkins MR于1994年提出.后来就被广泛引用了,此词的准确解释,没有.说法没有统一,带我的老师考过我,她说她博士后进站时老板也考过她.不好答.有兴趣的可以查一下<生物化学>杂志2003年专门有一篇中科院的文章讨论这个问题.+ ]# ?$ R' _+ z! v! i( e
测序的方法,简单的说就是个化学问题.提取蛋白,纯化,跑二维电泳,过质谱.完了.
3 y. L5 f" ^3 L2 n复杂的说,三天三夜也不够.光提取一个细胞器蛋白(如线粒体),你做好了,差不多就nobel了.* C r- h. N" |0 F
目的： 现实一点,从经济角度简说一下.大家知道蛋白质是致病因子对机体作用的靶分子,是发现药靶的技术平台.而药靶则是制药业的源头.例:20世纪90年代中期有483个药靶,2000种药,80%的是针对这483种药靶.所以,你只有进行测序,从结构推测功能,才能找到更多的新药靶.才能攻克各种不治之症.这里面的商机无限啊!!( n6 \# d: I; d! V* D% q! ^% Z) n
美国立肿瘤研究所出资1000万美圆用于建立蛋白质组数据库.
! B, X) Z. _5 j欧共体投巨资建立酵母蛋白质组数据库.! b$ R5 s* R1 p" `9 P% {
英生物技术科研委在全国建立3个研究中心
0 V. h5 t6 U7 e! W# X法建立5个区域性遗传基地,1500万美圆.
5 }* i& i: e& ]2 I% q' _5 ?德700美圆,在东德建立中心.9 c, v0 R. L l) o( u: q1 L
澳1997年计划提出人进行全国动员.; }" h3 w! D( r9 g6 q( r
日300万美圆,并提出"生物兴国"计划.+ n9 A7 M" o4 f4 X- V! R; B
无数生物公司加入此次竞争......
, v+ W, a" Z: ^) O0 B 蛋白质组是宏观与微观,动态与静态的桥梁,上承基因组,下启基因制药.前途无可限量.在这个战略上,我国只能从开始不能落后,勇攀前沿,进行蛙跳,才能在接下来竞争更为残酷的制药竞争中不被淘汰.( Q1 D! t3 Y6 g0 ]7 N7 Y
人才,是这次大战的争夺制高点.我们这次大潮赶上了,但知识还远远不够.希望大家在制药大潮来临时,长风破浪,直挂云帆
发表于 2007-12-11 15:59:05