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为什么进行蛋白质测序?
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这个问题问的非常有意义.没有学生物的人也知道,基因组测序,为了破译遗传密码.现在密码已破,那进行蛋白质组测序有必要吗?
A# ]% e/ e) i0 d" K' ] 基因研究贯穿了整个20世纪,100多年里,双螺旋结构的提出,中心法则的发现,直至基因组的重大突破,使基因研究达到了前所未有的深度与广度.
/ v& n6 M, m" T7 C# f) v6 n, N6 Q 然而,基因只是信息的携带者,蛋白质才是执行者.基因组计划有其固有的局限性,基因组测序是否正确,要从其表达的蛋白来验证,否则,只是一堆乱码而已.3.5万左右基因中一半以上是理论推断,需要从蛋白质角度确认.而且,从蛋白质研究的自身发展来看,我们无法逃避蛋白质组表达谱分析,只是时间问题而已. |8 q9 s2 }( s" v/ B. n
以前,对蛋白质的研究是优于基因的,因为PCR,测序自动化使其发展迅猛,这我在明天的生物中提了.80年代末,Hillen Kamp发展的激光解析质谱,Fem J设计的电喷雾质谱可以高效,精确的测量生物大分子的质量,并测定部分序列,进而用于数据库的检索.Mann M等再此基础上通过建立"肽质量指纹图谱与肽序列标签"等技术实现了质谱对蛋白质进行大规模准确快速自动化的测序.) V/ l/ h4 D! s! i# H2 q: X
蛋白质组(即protenome=protein+genome)是两个词的组合,Wilkins MR于1994年提出.后来就被广泛引用了,此词的准确解释,没有.说法没有统一,带我的老师考过我,她说她博士后进站时老板也考过她.不好答.有兴趣的可以查一下<生物化学>杂志2003年专门有一篇中科院的文章讨论这个问题.; o; \# y6 `. a/ V
测序的方法,简单的说就是个化学问题.提取蛋白,纯化,跑二维电泳,过质谱.完了.
: v8 f$ T. r$ U/ _$ R: C9 g( g7 S复杂的说,三天三夜也不够.光提取一个细胞器蛋白(如线粒体),你做好了,差不多就nobel了.% S: k. q' f8 M
目的： 现实一点,从经济角度简说一下.大家知道蛋白质是致病因子对机体作用的靶分子,是发现药靶的技术平台.而药靶则是制药业的源头.例:20世纪90年代中期有483个药靶,2000种药,80%的是针对这483种药靶.所以,你只有进行测序,从结构推测功能,才能找到更多的新药靶.才能攻克各种不治之症.这里面的商机无限啊!!! K9 }/ f2 ^7 h0 } Q! @
美国立肿瘤研究所出资1000万美圆用于建立蛋白质组数据库.7 V( J( a0 G. C1 E
欧共体投巨资建立酵母蛋白质组数据库. w6 Q. c* Q: w) _$ U" } O5 c
英生物技术科研委在全国建立3个研究中心8 n; i' I8 A+ w
法建立5个区域性遗传基地,1500万美圆.
. q- d0 s) [+ ^" w0 W. g德700美圆,在东德建立中心.
4 A" e7 Z, `/ m+ ~ V澳1997年计划提出人进行全国动员.
# l ~6 h& W% H9 v$ w, n0 h% d日300万美圆,并提出"生物兴国"计划.
. n# o- s" S/ N! }. `无数生物公司加入此次竞争......
# l' C$ Q" d% L+ M1 C+ x" t8 I 蛋白质组是宏观与微观,动态与静态的桥梁,上承基因组,下启基因制药.前途无可限量.在这个战略上,我国只能从开始不能落后,勇攀前沿,进行蛙跳,才能在接下来竞争更为残酷的制药竞争中不被淘汰.
* q7 j' C3 N1 Z( [9 M9 v 人才,是这次大战的争夺制高点.我们这次大潮赶上了,但知识还远远不够.希望大家在制药大潮来临时,长风破浪,直挂云帆
发表于 2007-12-11 15:59:05