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为什么进行蛋白质测序?- ]7 a/ P8 f6 Z2 H4 ~' Y; s7 i
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这个问题问的非常有意义.没有学生物的人也知道,基因组测序,为了破译遗传密码.现在密码已破,那进行蛋白质组测序有必要吗?
1 n7 E2 h4 n, c. |( w2 K 基因研究贯穿了整个20世纪,100多年里,双螺旋结构的提出,中心法则的发现,直至基因组的重大突破,使基因研究达到了前所未有的深度与广度.9 B( Q. y$ T2 O, b# f8 t
然而,基因只是信息的携带者,蛋白质才是执行者.基因组计划有其固有的局限性,基因组测序是否正确,要从其表达的蛋白来验证,否则,只是一堆乱码而已.3.5万左右基因中一半以上是理论推断,需要从蛋白质角度确认.而且,从蛋白质研究的自身发展来看,我们无法逃避蛋白质组表达谱分析,只是时间问题而已.( t7 s$ z2 n$ \/ z6 Q
以前,对蛋白质的研究是优于基因的,因为PCR,测序自动化使其发展迅猛,这我在明天的生物中提了.80年代末,Hillen Kamp发展的激光解析质谱,Fem J设计的电喷雾质谱可以高效,精确的测量生物大分子的质量,并测定部分序列,进而用于数据库的检索.Mann M等再此基础上通过建立"肽质量指纹图谱与肽序列标签"等技术实现了质谱对蛋白质进行大规模准确快速自动化的测序.
& g. Z$ `$ E* T X 蛋白质组(即protenome=protein+genome)是两个词的组合,Wilkins MR于1994年提出.后来就被广泛引用了,此词的准确解释,没有.说法没有统一,带我的老师考过我,她说她博士后进站时老板也考过她.不好答.有兴趣的可以查一下<生物化学>杂志2003年专门有一篇中科院的文章讨论这个问题.
) _0 t5 U: r w6 c$ D 测序的方法,简单的说就是个化学问题.提取蛋白,纯化,跑二维电泳,过质谱.完了.
# Z- H& T9 k2 R( A" @复杂的说,三天三夜也不够.光提取一个细胞器蛋白(如线粒体),你做好了,差不多就nobel了.
/ `4 [& K, T$ ?目的： 现实一点,从经济角度简说一下.大家知道蛋白质是致病因子对机体作用的靶分子,是发现药靶的技术平台.而药靶则是制药业的源头.例:20世纪90年代中期有483个药靶,2000种药,80%的是针对这483种药靶.所以,你只有进行测序,从结构推测功能,才能找到更多的新药靶.才能攻克各种不治之症.这里面的商机无限啊!!
& z) o+ n( v& I2 u. _美国立肿瘤研究所出资1000万美圆用于建立蛋白质组数据库.
" \+ y, \/ I3 H( P6 O; i" b" C0 T; {欧共体投巨资建立酵母蛋白质组数据库.
& E. _4 [: Z& W% f英生物技术科研委在全国建立3个研究中心
4 a0 ^+ u5 `3 p) _法建立5个区域性遗传基地,1500万美圆.
) k: l. L5 Z; D- S$ K德700美圆,在东德建立中心.3 v. |. B+ s6 M( z* d
澳1997年计划提出人进行全国动员.# Y4 j* C* L0 b2 K X9 Y+ T4 V
日300万美圆,并提出"生物兴国"计划.
/ h1 U+ h' G8 N) E+ T无数生物公司加入此次竞争......
6 T, W& c6 J( { j 蛋白质组是宏观与微观,动态与静态的桥梁,上承基因组,下启基因制药.前途无可限量.在这个战略上,我国只能从开始不能落后,勇攀前沿,进行蛙跳,才能在接下来竞争更为残酷的制药竞争中不被淘汰.
+ q' U; d; Z: S" ^ 人才,是这次大战的争夺制高点.我们这次大潮赶上了,但知识还远远不够.希望大家在制药大潮来临时,长风破浪,直挂云帆
发表于 2007-12-11 15:59:05